Центр довузовской подготовки тесно сотрудничает с администрациями районов и  Управлениями общего образования Новосибирской области. На сегодняшний день заключены договора о совместной организации довузовской подготовки школьников 9-11 классов со средними учебными заведениями. По этому договору университет и школа разрабатывают совместные учебные планы и рабочие программы учащихся по агротехнологическому профилю, привлекают учащихся к участию в научных конференциях, семинарах, конкурсах, исследовательских проектов, олимпиадах.